Gonca Dönmez Arat1 2Department of Internal Medicine Oncology, İstanbul Atlas University Faculty of Medicine, İstanbul, Türkiye
3Department of Medical Oncology, İstinye University Faculty of Medicine, İstanbul, Türkiye
4Department of Molecular Biology and Genetics, Cumhuriyet University Faculty of Science, Sivas, Türkiye
Abstract
Introduction: Changes in protein encoding genes involved in various signalling pathways are effective in the development of breast cancer. The (WNT)/β-catenin pathway is known to have a role in many cancer types, including breast cancer. In this study we aimed to investigate the relationship between the risk of breast cancer development and WNT antagonist gene polymorphisms in a selected Turkish population.
Materials and Methods: In total, 100 patients who were diagnosed with breast cancer and 100 age-matched and sex-matched healthy individuals were evaluated in this study. We genotyped 4 single nucleotide polymorphisms including DKK3 non-synonymous (Exon7 Arg335Gly), DKK3 (Intron4 G/C), DKK4 synonymous (Exon4 V169V), sFRP4 non-synonymous (Exon6 R340K) by performing polymerase chain reactions (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP).
Results: In statistical analysis using Chi-square (χ2) test, we observed that there was no significant difference between case and control groups for distribution of DKK3 nonsynonymous exon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C polymorphisms and sFRP4 non-synonymous (Exon6 R340K) (p>0.05). On the other hand, distribution of DKK4 synonymous exon 4 V169V polymorphism between case and control groups was significantly different (p<0.05). However, a statistically significant correlation between breast cancer risk and CC genotype of DKK4 synonymous exon 4 V169V polymorphism (adjusted for BMI and sFRP4) has been defined [p=0.001, OR: 16.38 CI: 95% (6.37–42.12)].
Discussion and Conclusion: These results suggest that the CC genotype of DKK4 synonymous exon 4 V169V polymorphism is associated with the development of breast cancers in Turkish population.
2İstanbul Atlas Üniversitesi, Tıp Fakültesi, İç Hastalıkları Onkolojisi Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye
3İstinye Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye
4Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Sivas, Türkiye
Amaç: Çeşitli sinyal yolaklarında yer alan protein kodlayan genlerdeki değişiklikler, meme kanserinin gelişiminde etkili olmaktadır. WNT/β-katenin yolunun, meme kanseri de dâhil olmak üzere birçok kanser türünde rol oynadığı bilinmektedir. Bu çalışmada, seçilmiş bir Türk popülasyonunda meme kanseri gelişme riski ile WNT antagonist gen polimorfizmleri arasındaki ilişkiyi araştırmayı amaçladık.
Yöntem: Bu çalışmada, meme kanseri tanısı almış 100 hasta ile yaş ve cinsiyet açısından eşleştirilmiş 100 sağlıklı birey değerlendirildi. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ve kısıtlama parça uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemleriyle DKK3 non-sinonim (Ekzon 7 Arg335Gly), DKK3 (İntron 4 G/C), DKK4 sinonim (Ekzon 4 V169V) ve sFRP4 non-sinonim (Ekzon 6 R340K) olmak üzere dört tek nükleotid polimorfizmini genotipledik.
Bulgular: Ki-kare (χ²) testi kullanılarak yapılan istatistiksel analizde, DKK3 non-sinonim ekzon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C polimorfizmleri ve sFRP4 non-sinonim (Ekzon 6 R340K) dağılımları açısından olgu ve kontrol grupları arasında anlamlı bir fark gözlenmedi (p>0.05). Öte yandan, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V polimorfizminin olgu ve kontrol grupları arasındaki dağılımı anlamlı derecede farklıydı (p<0.05). Bununla birlikte, vücut kitle indeksi (BMI) ve sFRP4 için ayarlama yapıldığında, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V polimorfizminin CC genotipi ile meme kanseri riski arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki tanımlandı [p=0.001, OR: 16.38, GA: %95 (6.37–42.12)].
Sonuç: Bu sonuçlar, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V polimorfizminin CC genotipinin Türk popülasyonunda meme kanserinin gelişimi ile ilişkili olduğunu düşündürmektedir.
